Sélection des levures : le Breeding assisté par marqueur QTL

Breeding

• Consiste à croiser des souches présentant des caractéristiques technologiques d’intérêt œnologique.
• La souche obtenue associe les performances de deux ou plusieurs souches différentes.

Marqueurs QTL

Des travaux alliant génétique et physiologie ont permis de mettre en évidence des caractéristiques génétiques directement liées à des traits physiologiques intéres- sants en œnologie, les QTL (caractère POF, production d’AV, production de SO₂, production d’arômes…). Il est donc possible d’aller chercher des levures avec des géno- types d’intérêts particuliers pour les travailler en breeding : c’est la sélection assistée par marqueurs.

Le saviez-vous ?

Le choix des souches parentales peut reposer sur des critères physi- ologiques (capacité fermentaire, faible production d’AV, de SO₂ , libération d’arômes…) mais aussi génétiques. En effet, nous savons maintenant qu’un certain nombre de caractéristiques génétiques (que l’on appelle QTL) sont liées à des traits physi- ologiques (phénotypes).

Utilisation des QTL

Permet de dépasser les résultats d’analyses uniquement basés sur les phénotypes fermentaires, de décupler les possibilités de sélection des spores parentales et de cibler précisément les axes d’optimisation du travail de sélection.

Breeding dirigé assisté par marqueurs QTL

Lorsqu’une souche A nécessite d’être améliorée sur un critère particulier présent dans une souche B, il est possible de réaliser un backcross assisté par marqueur génétique. Une fois la souche A croisée avec la souche B, le descendant portant le QTL d’intérêt est identifié, puis croisé à nouveau avec la souche A. Cette opération est répétée jusqu’à obtenir une souche X comportant une majorité du génome de la souche A, enrichie des performances objectivées de la souche B.